在{九五年完成了CPE第一個單元（Unit）之後，陳碧雲對自己事奉的方向，有了一個抉擇。九六年的九月，她踏入了醫院，披上院牧的袍子。
由於浸信會醫院對院牧的要求，是要修讀四個單元的CPE，所以她在九七年和九九年分別再修讀了第二和第三個單元的CPE。她坦言，完成了第一個單元之後，感到很興奮，覺得自己成長了，內在的自由多了，十分雀躍。所以十分渴望再修第二個單元，而第二個單元亦帶給她不少幫助。
只是第二個單元才完成不久，醫院很快就安排她再修第三個單元時，她卻出現猶豫。回想這一次經驗，陳碧雲認為一方面可能兩次課程太接近，而且又不是自己預備妥當而選擇，所以心裏有抗拒。另一方面是CPE課程的設計，是反省／行動／再反省，學員要自我準備，更需要空間。換言之，太忙或太緊張，都不是修讀CPE的好時機。有心進修的人，必需要預備時間，並要有面對挑戰的心理準備，身體的狀態和靈性的預備同樣重要。因此，當時她擔心自己會浪費時間，又恐怕自己應付不了。
回顧之前三個單元帶來的改變，期盼即將修讀第四個單元，陳碧雲這樣總結CPE帶給她的改變。第一個單元的改變是明顯的，連朋友也看得出來。她在當中發現自己受成長背景影響，欠缺自信。透過課程的幫助和同學的接納，她發現自己，也學會接納自己，比以前自由了，空間也多了。
第二個單元之中，她處理更多之前尚未處理妥的問題，好像焦慮、緊張等。這些內在問題其實影響著她與人合作。在課程之中，她學會面對問題，突破自己。她說，進步好像不如第一個單元，但自己知道又跨前一步了。
至於第三個單元，因為不是自己計劃之中，本想逃避，卻又逃避不了。但正因如此，她又發現自己深層還有不願對質、喜歡逃避、害怕衝突、埋藏忿怒情緒等等的問題。上帝似乎不待她準備，要把她拆毀、建造。她說，第三個單元的成果，同事們最明白。
在進修CPE的過程中，陳碧雲經驗到不是知識上的增加，而是生命的不斷更新。所以，她認為每一個負責牧養工作的人，若能進修CPE定必有所幫助。而神學生入工場前最好先修CPE。牧者在職時，每隔一段時間，能修一個單元，一定能夠有更好的牧養果效。